Công tác tái khởi động một NMLD với quy mô lớn như trên là một quy trình khá phức tạp, bao gồm việc khôi phục lại nguồn điện cho nhà máy và tái vận hành khoảng 10 phân xưởng trong khi các phân xưởng này thường xảy ra lỗi ngưng hoạt động. Tuy nhiên, Shell dự kiến sẽ hoàn thành tái khởi động nhà máy sớm hơn so với kế hoạch đề ra ban đầu trong 2 tuần. 

Theo Energy Aspects, công ty tư vấn phân tích thị trường sản phẩm dầu mỏ, cho biết khi NMLD Pernis hoạt động trở lại cùng với việc một lượng lớn dầu diesel được nhập khẩu dự kiến sẽ khiến cho lợi nhuận biên trong ngành lọc dầu sụt giảm trong ngắn hạn.